Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc1P02468 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc1P02468 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc1P02468 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc1P02468 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Lamc1P02468 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lamc1P02468 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Lamc1P02468 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lamc1P02468 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lamc1P02468 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms