Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col4a1P02463 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col4a1P02463 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col4a1P02463 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col4a1P02463 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col4a1P02463 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a1P02463 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a1P02463 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col4a1P02463 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms