Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01741 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01741 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01741 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01741 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01741 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01741 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01741 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01741 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01741 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01741 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01741 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01741 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01741 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01741 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01741 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01741 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01741 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01741 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01741 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01741 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01741 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01741 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01741 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01741 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01741 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01741 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01741 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01741 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01741 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01741 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01741 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01741 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01741 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01741 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01741 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01741 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01741 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01741 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01741 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01741 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01741 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms