Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01729 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01729 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01729 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01729 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01729 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01729 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01729 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01729 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01729 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01729 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01729 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01729 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01729 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01729 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01729 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01729 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01729 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01729 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01729 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01729 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01729 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01729 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01729 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01729 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01729 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01729 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01729 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01729 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms