Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01648 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01648 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01648 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01648 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01648 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01648 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01648 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01648 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01648 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01648 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01648 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01648 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01648 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01648 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01648 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01648 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P01648 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01648 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01648 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01648 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01648 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
P01648 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01648 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01648 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01648 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01648 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01648 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01648 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01648 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01648 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01648 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01648 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01648 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01648 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01648 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01648 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01648 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01648 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01648 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01648 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01648 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01648 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01648 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01648 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01648 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01648 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P01648 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01648 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P01648 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01648 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01648 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01648 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01648 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01648 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01648 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01648 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01648 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01648 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01648 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P01648 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01648 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01648 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P01648 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01648 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01648 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01648 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01648 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01648 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01648 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01648 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01648 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01648 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms