Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01646 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01646 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01646 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01646 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01646 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01646 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01646 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01646 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01646 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01646 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01646 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01646 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01646 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01646 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01646 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01646 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01646 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
P01646 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01646 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01646 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01646 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01646 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P01646 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01646 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01646 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01646 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01646 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01646 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01646 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01646 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01646 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01646 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01646 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01646 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01646 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01646 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01646 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01646 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01646 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01646 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01646 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01646 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
P01646 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01646 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01646 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P01646 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01646 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01646 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01646 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01646 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01646 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01646 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01646 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01646 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01646 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01646 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01646 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01646 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01646 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01646 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01646 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01646 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01646 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01646 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01646 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01646 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01646 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01646 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01646 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01646 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01646 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01646 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01646 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms