Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PomcP01193 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PomcP01193 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PomcP01193 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PomcP01193 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PomcP01193 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PomcP01193 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PomcP01193 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PomcP01193 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PomcP01193 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PomcP01193 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PomcP01193 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PomcP01193 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PomcP01193 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PomcP01193 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PomcP01193 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PomcP01193 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PomcP01193 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PomcP01193 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PomcP01193 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PomcP01193 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PomcP01193 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PomcP01193 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PomcP01193 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PomcP01193 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PomcP01193 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PomcP01193 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PomcP01193 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PomcP01193 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PomcP01193 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PomcP01193 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PomcP01193 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PomcP01193 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PomcP01193 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms