Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vti1aO89116 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vti1aO89116 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vti1aO89116 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms