Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tom1O88746 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tom1O88746 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tom1O88746 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tom1O88746 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tom1O88746 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tom1O88746 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tom1O88746 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tom1O88746 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tom1O88746 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tom1O88746 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tom1O88746 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tom1O88746 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tom1O88746 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms