Protein–RNA interactions for Protein: O88741

Gdap1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdap1O88741 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gdap1O88741 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdap1O88741 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdap1O88741 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdap1O88741 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdap1O88741 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdap1O88741 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdap1O88741 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdap1O88741 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms