Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh7O88451 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdh7O88451 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdh7O88451 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh7O88451 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh7O88451 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh7O88451 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms