Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc4a4O88343 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc4a4O88343 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc4a4O88343 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc4a4O88343 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms