Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nid2O88322 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nid2O88322 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nid2O88322 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nid2O88322 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Nid2O88322 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nid2O88322 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nid2O88322 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nid2O88322 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nid2O88322 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nid2O88322 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nid2O88322 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nid2O88322 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nid2O88322 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nid2O88322 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Nid2O88322 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nid2O88322 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms