Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6aO70546 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6aO70546 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6aO70546 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm6aO70546 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 572.4 ms