Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn4O70507 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hcn4O70507 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms