Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx12O70493 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx12O70493 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx12O70493 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx12O70493 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx12O70493 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx12O70493 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx12O70493 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx12O70493 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx12O70493 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx12O70493 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms