Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtssO70370 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtssO70370 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtssO70370 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtssO70370 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtssO70370 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtssO70370 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtssO70370 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CtssO70370 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtssO70370 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtssO70370 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtssO70370 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtssO70370 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtssO70370 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtssO70370 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtssO70370 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtssO70370 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtssO70370 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CtssO70370 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtssO70370 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtssO70370 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtssO70370 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CtssO70370 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtssO70370 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtssO70370 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtssO70370 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtssO70370 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CtssO70370 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtssO70370 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtssO70370 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtssO70370 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtssO70370 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtssO70370 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CtssO70370 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtssO70370 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtssO70370 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtssO70370 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtssO70370 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CtssO70370 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtssO70370 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtssO70370 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtssO70370 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtssO70370 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtssO70370 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtssO70370 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtssO70370 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtssO70370 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtssO70370 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtssO70370 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtssO70370 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CtssO70370 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtssO70370 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtssO70370 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtssO70370 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtssO70370 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtssO70370 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CtssO70370 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtssO70370 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtssO70370 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtssO70370 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtssO70370 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtssO70370 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtssO70370 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtssO70370 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtssO70370 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtssO70370 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtssO70370 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtssO70370 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtssO70370 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtssO70370 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtssO70370 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtssO70370 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtssO70370 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtssO70370 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtssO70370 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtssO70370 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtssO70370 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtssO70370 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtssO70370 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtssO70370 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtssO70370 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtssO70370 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CtssO70370 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtssO70370 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms