Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gfi1bO70237 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfi1bO70237 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfi1bO70237 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms