Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna4O70174 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrna4O70174 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms