Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtogO55225 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtogO55225 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtogO55225 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtogO55225 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtogO55225 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtogO55225 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtogO55225 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtogO55225 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtogO55225 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtogO55225 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtogO55225 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtogO55225 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtogO55225 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtogO55225 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtogO55225 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtogO55225 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtogO55225 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtogO55225 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtogO55225 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtogO55225 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtogO55225 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtogO55225 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OtogO55225 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtogO55225 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtogO55225 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtogO55225 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtogO55225 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtogO55225 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtogO55225 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtogO55225 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtogO55225 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtogO55225 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtogO55225 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OtogO55225 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtogO55225 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtogO55225 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OtogO55225 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtogO55225 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtogO55225 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtogO55225 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtogO55225 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtogO55225 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtogO55225 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtogO55225 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtogO55225 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtogO55225 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtogO55225 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms