Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syngr1O55100 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syngr1O55100 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms