Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nr1i2O54915 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1i2O54915 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms