Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb3O54890 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb3O54890 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3O54890 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms