Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EomesO54839 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EomesO54839 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EomesO54839 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EomesO54839 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EomesO54839 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EomesO54839 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EomesO54839 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EomesO54839 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EomesO54839 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EomesO54839 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EomesO54839 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EomesO54839 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EomesO54839 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EomesO54839 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EomesO54839 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EomesO54839 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EomesO54839 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EomesO54839 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EomesO54839 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EomesO54839 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EomesO54839 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EomesO54839 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EomesO54839 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EomesO54839 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EomesO54839 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EomesO54839 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EomesO54839 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EomesO54839 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EomesO54839 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EomesO54839 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EomesO54839 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EomesO54839 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EomesO54839 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EomesO54839 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EomesO54839 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EomesO54839 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EomesO54839 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EomesO54839 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EomesO54839 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EomesO54839 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EomesO54839 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EomesO54839 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EomesO54839 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EomesO54839 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EomesO54839 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EomesO54839 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EomesO54839 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EomesO54839 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EomesO54839 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EomesO54839 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EomesO54839 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EomesO54839 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EomesO54839 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EomesO54839 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EomesO54839 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EomesO54839 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EomesO54839 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EomesO54839 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EomesO54839 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EomesO54839 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EomesO54839 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms