Protein–RNA interactions for Protein: O54774

Ap3d1, AP-3 complex subunit delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3d1O54774 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3d1O54774 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3d1O54774 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap3d1O54774 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms