Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp15O54732 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp15O54732 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp15O54732 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp15O54732 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp15O54732 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp15O54732 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp15O54732 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp15O54732 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms