Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab33bO35963 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms