Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms