Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg3O35902 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg3O35902 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg3O35902 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms