Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phox2bO35690 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phox2bO35690 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Phox2bO35690 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms