Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pold2O35654 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pold2O35654 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pold2O35654 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pold2O35654 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pold2O35654 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pold2O35654 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pold2O35654 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms