Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaxO35602 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaxO35602 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaxO35602 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaxO35602 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaxO35602 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RaxO35602 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaxO35602 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RaxO35602 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RaxO35602 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RaxO35602 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaxO35602 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaxO35602 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RaxO35602 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RaxO35602 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RaxO35602 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RaxO35602 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaxO35602 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaxO35602 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RaxO35602 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RaxO35602 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RaxO35602 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaxO35602 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaxO35602 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaxO35602 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaxO35602 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RaxO35602 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RaxO35602 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RaxO35602 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RaxO35602 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RaxO35602 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaxO35602 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaxO35602 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaxO35602 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaxO35602 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaxO35602 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RaxO35602 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaxO35602 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaxO35602 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RaxO35602 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaxO35602 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaxO35602 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaxO35602 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RaxO35602 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RaxO35602 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RaxO35602 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RaxO35602 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RaxO35602 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RaxO35602 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaxO35602 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaxO35602 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaxO35602 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaxO35602 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaxO35602 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaxO35602 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaxO35602 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaxO35602 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaxO35602 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaxO35602 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaxO35602 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaxO35602 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaxO35602 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaxO35602 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaxO35602 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaxO35602 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaxO35602 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaxO35602 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaxO35602 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RaxO35602 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RaxO35602 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RaxO35602 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaxO35602 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaxO35602 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaxO35602 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaxO35602 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaxO35602 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaxO35602 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms