Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccrl2O35457 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccrl2O35457 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccrl2O35457 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms