Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf11O35235 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf11O35235 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf11O35235 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms