Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cldn4O35054 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn4O35054 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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