Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MttpO08601 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MttpO08601 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MttpO08601 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MttpO08601 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MttpO08601 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MttpO08601 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MttpO08601 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MttpO08601 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MttpO08601 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MttpO08601 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MttpO08601 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MttpO08601 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MttpO08601 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MttpO08601 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MttpO08601 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MttpO08601 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MttpO08601 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MttpO08601 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MttpO08601 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MttpO08601 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MttpO08601 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MttpO08601 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MttpO08601 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MttpO08601 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MttpO08601 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MttpO08601 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MttpO08601 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MttpO08601 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MttpO08601 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MttpO08601 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MttpO08601 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MttpO08601 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MttpO08601 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MttpO08601 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MttpO08601 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MttpO08601 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MttpO08601 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MttpO08601 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MttpO08601 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MttpO08601 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms