Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AlyrefO08583 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AlyrefO08583 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AlyrefO08583 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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