Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm3278L7N2D2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm3278L7N2D2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm3278L7N2D2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm3278L7N2D2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm3278L7N2D2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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