Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2al1oL7MU04 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2al1oL7MU04 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms