Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3383J3QQ59 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3383J3QQ59 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3383J3QQ59 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3383J3QQ59 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms