Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5849J3QPE5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5849J3QPE5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms