Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9602J3QPD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9602J3QPD5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms