Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Gm21972J3QN38 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Gm21972J3QN38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Gm21972J3QN38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Gm21972J3QN38 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm21972J3QN38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm21972J3QN38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Gm21972J3QN38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Gm21972J3QN38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21972J3QN38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Gm21972J3QN38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Gm21972J3QN38 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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