Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20918J3QN17 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20918J3QN17 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms