Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm21820J3KMU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm21820J3KMU2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm21820J3KMU2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms