Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm29394H3BIW7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gm29394H3BIW7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm29394H3BIW7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms