Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r34G3XA52 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms