Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933406M09RikG3XA12 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933406M09RikG3XA12 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms