Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
2610008E11RikG3X964 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
2610008E11RikG3X964 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2610008E11RikG3X964 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms