Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna9G3X8Z7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna9G3X8Z7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna9G3X8Z7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms